Mortens hovedområde for klinisk og forskningsmæssig interesse er trombose, atrieflimren og iskæmisk hjertesygdom. H-faktor er 25. Han har været akademisk rådgiver på syv afsluttede ph.d.-projekter fra Københavns Universitet.

Ekspertise inden for arytmi og trombose.

Reviewer af ESC-retningslinjerne for lungeemboli 2014.